Het in kaart brengen van het darmflora geeft ons meer kennis
over de rol ervan bij overgewicht
Dr. Katherine Pollard bespreekt innovatieve
statistische analyses die een nieuw licht werpen op het verband
tussen darmbacteriën, metabolisme en BMI
Verschillende recente wetenschappelijke studies
stellen in verband met het darmmicrobioom dat de diversiteit aan
bacteriën in de maag en de darmen wel eens de schuld zou kunnen zijn
voor obesitas. Maar Katherine Pollard, PhD, senior onderzoeker bij
Gladstone Institutes, zegt dat het niet zo eenvoudig is.
Met behulp van krachtige computers, hebben Dr.
Pollard en haar team eerdere studies opnieuw geanalyseerd en daaruit
is gebleken dat er geen significante relatie is tussen de body mass
index (BMI) en de soorten microben in de darmen. In feite vond ze in
haar lab dat er grotere verschillen waren in darmbacteriën tussen de
verschillende studies dan tussen magere en zwaarlijvige individuën
binnen elke studie.
In plaats daarvan denkt Dr. Pollard denkt dat de
genetische make-up van de verschillende stammen van bacteriën het
belangrijkst is. Dit komt omdat het DNA in bacteriën enorm varieert.
Terwijl bijvoorbeeld de genomen van twee mensen slechts 0,1%,van
elkaar verschillen kunnen twee stammen van dezelfde bacteriën 30%
van elkaar variëren - vergelijkbaar met de variatie tussen
menselijke genomen en die van muizen! Wat meer is, de verschillen in
de bacteriële genomen zijn belangrijke onderdelen die vaak betrokken
zijn bij het metabolisme of de verwerking van suiker en vet.
Buiten het reflecteren van belangrijke functionele
veranderingen in bacteriële genomen, beïnvloeden verlies en aangroei
van genen ook de grootte van het genoom. Wanneer microbiomen
bestudeerd worden met metagenomics - rangschikken van DNA - kunnen
verschillen in bacteriële genoom grootte een vertekening geven van
de schatting van het aandeel van elk gen in het monster. Door het
ontwikkelen van een computer snelkoppeling om snel de genoomgrootte
te schatten met behulp van statistische modellen, was het voor Dr
Pollard's team mogelijk om de correctheid van microbiële studies te
verbeteren.
"Het is niet genoeg om te zeggen wat voor soort
bacteriën aanwezig zijn, omdat dit niets zegt van wat zij aan het
doen zijn," legt Dr Pollard uit. “Daar twee stammen van dezelfde
soort verschillende genomen kunnen hebben, moet je echt weten over
welke genen het gaat en welke rol ze spelen in het verband tussen
iemands darmflora en de BMI of ziekte."
http://www.gladstone.ucsf.edu
Vertaling: Andre Teirlinck
